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　　日前，記者從位于天津港保稅區的中國科學院天津工業生物技術研究所（以下簡稱“天津工業生物所”）了解到，天津工業生物所生物設計中心平臺實驗室與亞馬遜云科技共同推動生物計算設計發展，目前已推出全球首個基于圖數據庫的大腸桿菌調控代謝關系知識圖譜ERMer和全流程高通量編輯序列設計云平臺AutoESD等20多項生物計算設計工具和軟件應用。

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　　圖數據庫助力構建　　專業大腸桿菌調控代謝知識圖譜　　2019年，天津工業生物所成立生物設計中心平臺實驗室，并圍繞生物計算設計，開始與亞馬遜云科技共同探索生物技術和信息技術相結合（BT+IT）的技術體系，進一步推動合成生物學發展，為健康、能源、農業和環境等領域研究的重大突破提供技術支撐。

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　　據了解，天津工業生物所生物設計中心團隊聯合亞馬遜云科技團隊在計算生物學國際期刊《Nucleic Acids Research》上發表文章，并發布了全球首個基于圖數據庫Amazon Neptune的大腸桿菌調控代謝關系知識圖譜ERMer，首次提供了全局的代謝調控圖譜，并通過可視化框架實現了豐富的搜索功能，如多步查詢、最短路徑查詢等。

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ERMer采用專門為高度關聯復雜數據集高效存儲和查詢設計的圖數據庫架構，打破了傳統的低效數據檢索方式，有效增進用戶和圖譜的人機交互，大大降低了使用門檻“為充分發揮知識圖譜的作用，生物設計中心團隊還進一步采用圖神經網絡技術進行推理，成功實現了轉錄因子預測和轉錄因子靶點預測等功能。

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這有助于挖掘潛在的關鍵調控因子和調控靶點，構建新的調控代謝網絡，為研究人員提供新的研究思路和方向”天津工業生物所生物設計中心副主任廖小平說　　加速生物計算設計工具研發　　總體擁有成本降低50%　　將合成生物學相關實驗流程模塊化、標準化，也是自動化研究中不可或缺的一環。

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據了解，面向微生物遺傳操作，天津工業生物所生物設計中心團隊目前還開發了第一個能夠在所有操作類型、任何基因組位點和跨物種上進行精確、自動化和高通量編輯序列設計的云平臺AutoESDAutoESD采用基于云端的無服務器架構，確保了高可靠性、高穩健性和可擴展性，能夠在幾分鐘內并行處理包含上千個編輯序列設計目標的數百個設計任務。

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　　天津工業生物所生物設計中心主任馬紅武告訴記者，這些Serverless服務幫助天津工業生物所生物設計中心團隊進一步簡化運維，使得開發人員可以專注于業務代碼和創新，與傳統開發方式相比，開發時間縮短75%，總體擁有成本降低50%。

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　　濱海新區科技局相關負責人表示，將充分發揮天津工業生物所的引領帶動作用，大力推進綠色生物合成、新型生物發酵等核心技術攻關，形成一批前沿自主創新產品，推動“四基、三鏈”自主創新產業體系構建，推動“平臺—企業—人才—資本—政策—組織”六位一體產業支撐生態構建。

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記者 單毅

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